Vykdyti gripo, COVID-19 ligos (koronaviruso infekcijos) ir kitų ūminių viršutinių kvėpavimo takų infekcijų epidemiologinę priežiūrą. Uždavinys – analizuoti, stebėti bei vertinti sergamumą ir tendencijas (pagal amžių, administracines teritorijas, ligų grupes ir kt.), vykdyti kitas teisės aktuose numatytas funkcijas: teikti informaciją visuomenei, suinteresuotoms institucijoms ir Europos ligų prevencijos ir kontrolės centrui.